曙光助力生命科学世界首个大科学装置,探索地球生命奥秘


项目背景


蛋白质科学研究(上海)设施是以各种大型科学仪器和先进技术集成为核心的规模化、系统化技术装备体系,将选择多种具有不同的空间分辨率和时间分辨率的研究技术装备,构成能够基本覆盖蛋白质结构与功能在空间尺度和时间尺度变化范围的研究技术系统。简称蛋白质设施。

蛋白质是由基因编码、多种氨基酸聚合而成的生物大分子,是所有生命形式与生命活动的主要物质基础和功能执行者。蛋白质研究的突破将从根本上阐明人类重大疾病的机理,为临床诊治提供新的方法和途径;揭示农作物生长发育规律,为优质高产农作物的新品种的选育提供技术储备,将对人口健康、农业、环境生态、国家安全等重大问题产生重要影响。


项目需求


上海设施主要建设蛋白质结构研究的9个系统:规模化蛋白质制备系统、蛋白质晶体结构分析系统、蛋白质核磁分析系统、集成化电镜分析系统、蛋白质动态分析系统、蛋白质修饰与相互作用分析系统、复合激光显微镜系统、分子影像系统、数据库与计算分析系统。其中将依托上海光源,建设蛋白质三维结构测定、蛋白质结构的动态过程研究和功能成像分析等5条光束线、6个实验站。其中数据库与计算分析系统需要对整体高性能计算和存储进行支撑。


解决方案


曙光为蛋白质设施提供的系统作为蛋白质设施专用数据库平台、高性能计算分析平台和国家蛋白质设施信息化支撑保障平台,承载生命科学院蛋白质研究核心技术系统的数据集中存储、备份和计算工作。整套系统提供CPU双精度浮点运算理论峰值28.9万亿次每秒,GPU双精度浮点运算理论峰值8.24万亿次每秒,蛋白质科学数据库可提供1000人并行访问,系统可对外提供云计算服务。

 

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国家蛋白质科学研究(上海)设施机房布局


客户收益


国家蛋白质科学研究(上海)设施的高性能计算和海量存储得到了有效支撑,未来,国家蛋白质科学研究(上海)设施将围绕蛋白质科学研究的前沿领域和国家人口健康与现代农业的战略需求,打造开放、协作、创新的国际一流蛋白质科学研究平台,充分发挥大科学装置的优势,助力中国生物医药产业。


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